勇、卡爾德和謬是從小在伊甸行星一起長大的老朋友。勇與卡爾德以航空事業(yè)為職志，謬則希望成為歌手。然而，當(dāng)三人在高中畢業(yè)時，因為一次不預(yù)期的意外，使得三人就此各分東西。而謬也為此放棄了成為歌手的理想，成為一個現(xiàn)實的商人?！　?040年，為了替換雷霆式戰(zhàn)鬥機(jī)，統(tǒng)合軍方展開了一項名為超新星的計畫，開發(fā)新一代的可變型戰(zhàn)鬥機(jī)。是時，卡爾德以通用銀河公司的試飛主任的身分，於伊甸行星上的新愛德華基地負(fù)責(zé)YF-21的測試工作。已是統(tǒng)合軍中尉的勇也在此時調(diào)返故鄉(xiāng)，以試飛員的身分加入超新星計畫，為另一競爭團(tuán)隊試飛YF-19。而成為夏濃之蘋果經(jīng)紀(jì)人的謬，則是為了公司的造勢活動而回到伊甸。在不預(yù)期的機(jī)緣中，三人終於又同時回到故鄉(xiāng)。這樣的重逢，挑起了他們心中塵封已久的心結(jié)。在新仇加舊恨下，勇與卡爾德兩人在超新星計畫中開始了激烈的互角?！　⊥瑫r，統(tǒng)合軍也正在進(jìn)行一項秘密計畫——開發(fā)取代有人飛機(jī)的無人戰(zhàn)鬥機(jī)鬼魂X-9，並將於第一次宇宙大戰(zhàn)勝利紀(jì)念日發(fā)表。這一陰影，正要降臨在超新星計畫與兩位主角的身上。這一次，他們將為過去的矛盾作出最後的總決算....