就快放暑假了，小學(xué)生上原康一在放學(xué)回家的路上撿到一塊大石頭。他把石頭帶回了家，沒(méi)想到用水一洗，里面竟跳出一只小河童來(lái)。小河童對(duì)他“咕”的叫了一聲，于是康一就給它取名為“小咕”。
　　小咕會(huì)說(shuō)人類(lèi)的語(yǔ)言，幾百年來(lái)他一直被埋在在地下。康一很快就和小咕成了好朋友，他們一起洗澡，一起吃飯，一起睡覺(jué)。而其它家庭成員也接受了小咕，小河童成了上原一家的秘密。
　　一天，小咕提出想回家和伙伴們?cè)谝黄??？狄粸榱俗屝」玖私馔饷娴氖澜纾那陌阉鼛Я顺鋈?。小咕發(fā)現(xiàn)環(huán)境已經(jīng)面目全非，大吃了一驚，這個(gè)不適合就河童生存的地方根本就找不到伙伴?？吹叫」倦y過(guò)，康一也不好受。他和小咕一起外出旅行，來(lái)到了還保存著河童傳說(shuō)的遠(yuǎn)野縣。兩人在美麗的大自然中找到了適合河童生活的地方，小咕愉快地在清澈的河里游了起來(lái)，康一也為它高興?？墒?，在這里也怎么都找不到其它河童?？狄宦?tīng)到村民們說(shuō)“抓住一只河童能得一千萬(wàn)呢！”，趕忙帶著小咕離開(kāi)了那里。
　　回到家，康一訝異地撞見(jiàn)了一個(gè)小報(bào)記者。原來(lái)那人聽(tīng)說(shuō)上原家養(yǎng)著一只河童，一定要拍照。小咕的秘密終于被大家知道了。康一的爸爸被公司勒令一定要讓河童上電視。為了上原一家，小咕答應(yīng)參加電視節(jié)目。然而在到場(chǎng)嘉賓里，它看到了一個(gè)長(zhǎng)得很像殺父兇手的人。就在小咕被恐懼包圍的時(shí)候，電視節(jié)目現(xiàn)場(chǎng)發(fā)生了意外。它拼命逃到了外面，然而無(wú)論跑到哪里都會(huì)看到黑壓壓的人群。
　　為了擺脫讓它害怕的人類(lèi)，小咕爬上了東京塔。夏季的烈日照得它精疲力竭。小咕俯瞰著城市，獨(dú)自低語(yǔ)道：“哪里都找不到一個(gè)安靜的地方，這里是人類(lèi)的窩。我已經(jīng)不行了。我要去爸爸那里……”