主人公潤(rùn)和有泉奈這個(gè)親妹妹，進(jìn)學(xué)校時(shí)是極其普通的高中生?？墒?，在過(guò)去被卷入父母死亡的事故，潤(rùn)和自己也丟失了以前的那段記憶，幸存下來(lái)的潤(rùn)和被親戚照顧著，與只剩下一人的骨肉親人泉奈一起持續(xù)著二人生活。然后，現(xiàn)在……開(kāi)始和泉奈上相同的高中，對(duì)兩人來(lái)說(shuō)，那里讓他們忘記過(guò)去而快樂(lè)。新的生活，環(huán)境，還有初遇。對(duì)原來(lái)生活在只有妹妹存在的世界的潤(rùn)和來(lái)說(shuō)，在這個(gè)街的生活分外的新鮮。 可是，不久潤(rùn)和由于事故而丟失了的記憶開(kāi)始恢復(fù)后，在幸?？鞓?lè)的生活中，對(duì)過(guò)去和現(xiàn)在和未來(lái)?yè)u擺不定的潤(rùn)和……所謂被潤(rùn)和的記憶掩蓋了的真實(shí)是……

　　故事講述兩派來(lái)到地球后，因?yàn)榘l(fā)生了一些“事件”，導(dǎo)致雙方外形大變（也解釋了兩系列風(fēng)格不同的原因）。也由于這些“事件”，變形金剛要隱藏于人類社會(huì)之中。如何去平衡一切關(guān)系是擎天柱作為領(lǐng)袖將要面臨的考驗(yàn)，本作品的標(biāo)題也由此而來(lái)。
　　值得一提的是，本次兩派領(lǐng)袖 擎天柱 和 威震天 的配音者是久違的夢(mèng)幻組合：來(lái)自初代動(dòng)畫的 Peter Cullen jijidy.com 和 Frank Welker！他們?cè)陂焺e電視版的變形金剛作品多年后，再次一起回來(lái)共演這雙經(jīng)典的死對(duì)頭！

　　有一個(gè)外號(hào)邋遢大王的小男孩，他特別邋遢，不講衛(wèi)生，信奉“不干不凈，吃了沒(méi)病”。這天，鼠王想征服人類、稱霸世界，于是想找個(gè)人來(lái)當(dāng)他的細(xì)菌武器的試驗(yàn)品。鼠國(guó)密探看中了邋遢大王，因?yàn)橹挥兴麜?huì)吃不干凈的東西，于是，邋遢大王喝了被老鼠下了藥的橘子水后，身子變成了和老鼠一樣大小，被老鼠密探騙到了老鼠王國(guó)！來(lái)到老鼠王國(guó)后，邋遢大王真正感到后悔了，想回家卻又無(wú)奈被關(guān)了起來(lái)。幸好邋遢大王認(rèn)識(shí)的好友小貓小狗把鼠博士準(zhǔn)備在他身上做實(shí)驗(yàn)的換掉了，邋遢大王才逃過(guò)一劫。邋遢大王最終能否逃出鼠國(guó)？

位于東京西部的巨大“學(xué)園都市”。在總?cè)丝谶_(dá)230萬(wàn)人，其中約8成是學(xué)生的這座都市中，實(shí)施著超能力開(kāi)發(fā)的特殊課程，學(xué)生們的能力被給予從“無(wú)能力Level 0”到“超能力Level 5”的六階段評(píng)價(jià)。高中生上條當(dāng)麻，也是住在學(xué)園都市的學(xué)生之一。他由于隱藏在右手中的力量——只要是異能之力，就連神的加護(hù)都能消除的“幻想殺手Imagine Breaker”，而被評(píng)價(jià)為名落孫山的“無(wú)能力”，過(guò)著充滿不幸的人生。而上條的學(xué)生生活，由于暑假開(kāi)始時(shí)從天而降的純白修女而發(fā)生了巨大的變化。自從與逃離“魔法”世界的她——“禁書目錄茵蒂克絲”相遇開(kāi)始，上條就被卷入了各種各樣的事件中。統(tǒng)率學(xué)園都市的“科學(xué)”方、與茵蒂克絲關(guān)聯(lián)的“魔法”方，在驚險(xiǎn)地解決雙方事件的過(guò)程中，他的人際關(guān)系也逐步擴(kuò)展。之后，魔法一方的十字教最大宗派羅馬正教，終于注意到上條的存在……。如同呼應(yīng)魔法方一般，科學(xué)方的學(xué)園都市也有所動(dòng)作。但也有與逐漸開(kāi)始對(duì)立的世界動(dòng)向抗?fàn)幍娜瞬粩喑霈F(xiàn)。那些通過(guò)與上條有所關(guān)聯(lián)，而使命運(yùn)大為改變的“英雄”們。他們挺身而出與世界對(duì)峙。如同上條當(dāng)麻做過(guò)的那樣。科學(xué)與魔法第三次交織之時(shí)，故事將大幅推進(jìn)?。?/p>