自西元20XX年，人類從肯亞圖爾卡納湖的湖畔挖出了一個名叫索哈爾(Zohar)的物體之后，便開始對它進行研究，后來有人重建出來所謂的“神之語言”，并建立電腦程式以啟動原始索哈爾，進行和上位領域的U-DO(上位領域當中的紅色波動存在)連結的連結實驗，但很不幸地，從上位領域流入下位領域的能量造成了事象變移，使地球(游戲中所謂的“失落耶路撒冷”)幾乎完從從宇宙中“消失”，人類因而被迫逃亡，離開地球。
　　到了四千年多后，在故事開始前十五的T.C.4753年，米爾奇亞行星(Miltia)爆發(fā)了所謂的米爾奇亞沖突事件，在此次事件當中，米爾奇亞行星的人類疑似遭到了格諾西斯(Gnosis)的攻擊，并在沖突事件后消失，但事件的真相卻因為米爾奇亞的消失而不為人知。在事件后，啟動原始索哈爾（后來人類制造出了十二具索哈爾模擬體，因此原有的索哈爾就被稱之為原始索哈爾）所需的神之語言、原始索哈爾的研究成果、米爾奇亞的U.M.N.座標等事物，都被封存在Y資料當中，而Y資料又被封存在百式觀測用合成人(Relian)M.O.M.O.的意識內，然而這么做卻引起了各方勢力對M.O.M.O.的爭奪，因此星團聯(lián)邦政府(游戲中統(tǒng)治各行星的政府，英文名Galaxy Federation)雇了一個名叫Ziggurat 8的生化人(Cyborg)，以保護M.O.M.O.的安全。
　　另一方面，在米爾奇亞沖突事件結束后的十幾年，也就是大約在游戲EPI開始的時候，當時最大的企業(yè)貝克達公司以對抗格諾西斯侵擾的名義，進行對格諾西斯用戰(zhàn)斗兵器KOS-MOS的開發(fā)計劃，但和當時多使用合成人(Relian)與生化人(Cyborg)的情況所不同的是，KOS-MOS是個純粹的機械制品。另一方面，在EPI開始時，參與KOS-MOS開發(fā)計劃的貝克達公司第一開發(fā)局研究人員卯月紫苑，正乘著當時載有還沒正式啟動的KOS-MOS的Woglinde號太空船進行旅途。但沒想到其太空船卻被沖著索哈爾而來的格諾西斯所攻擊，而KOS-MOS也在此時突然啟動，卯月紫苑因而被卷入一連串和格諾西斯及索哈爾有關的陰謀，以及會改變人類命運的事件當中……

深藍，鋼鐵飛龍團隊的副隊長，冷峻外表下藏著熾熱的心。他曾是警隊精英，后加入鋼鐵飛龍，以超凡槍法和預知未來的能力聞名。在一場危機四伏的潛入任務中，深藍憑借精準射擊化解重重機關，更以其敏銳的直覺預見敵人的陰謀。他不僅保護隊友于危難之間，更在關鍵時刻做出艱難抉擇，展現出非凡的領導力和犧牲精神。

　　人気PCゲームおよびそのTVアニメ版「らいむいろ戦奇譚」の続編であるTVアニメシリーズ。日露戦爭のさなか、新たな敵ファーデン騎士団がロシア側に暗躍。日本軍は、乙女の魂が秘める超パワー""魂色（こんじき）""を具現化させる""らいむ隊""の新部隊結成を図る。5人の少女たちの指揮官かつ教師役となった熱血漢?犬養(yǎng)強志朗の活躍は？　本作と同題で原作となるPCゲームもほぼ同時期に発売された。前作と異なり、自ら戦士となって戦う新男性主人公?強志朗の聲は『機動戦士ガンダムOO』などでも活躍の吉野裕行が熱演。

在艾倫他們居住的帕拉迪島之外，還存在一個其他人類居住的世界。當中一個國家「瑪雷」與其他各國爆發(fā)戰(zhàn)爭。陷入苦戰(zhàn)之際，他們決定要攻進帕拉迪島，把「始祖的巨人」搶過來。在這里又看到另一群孩子們拼命求生存的身影……