瀕臨死亡的前情報(bào)局特工閔基憲（孔劉 飾），偶然遇見擁有人類不死秘密的「永生人」徐福（樸寶劍 飾），閔基憲的最后一場任務(wù)是誓死守護(hù)徐福到安全之地，途中想占有永生人的龐大財(cái)團(tuán)與各方惡勢力展開大規(guī)模獵殺，讓他們的逃亡過程卷入驚天動(dòng)地的危險(xiǎn)局面....

圣誕之夜，卡森共和國水企業(yè)和哈里曼達(dá)拉公司簽訂協(xié)議的大廈門外，無數(shù)群眾聲討抗議。而就在此時(shí)，擔(dān)任護(hù)衛(wèi)的警察機(jī)動(dòng)部隊(duì)突然掏槍對示威群眾展開無差別屠殺。血腥恐怖的事件背后，神秘病毒“火種”若隱若現(xiàn)。在與不明敵人對決過程中，草薙素子（坂本真綾 配音）和獨(dú)立機(jī)動(dòng)部隊(duì)的同伴們救下了全身義體的少女津田艾瑪（茅野愛衣 配音），其身上似乎隱藏著利用虛擬記憶進(jìn)行恐怖活動(dòng)的事實(shí)。公安9課課長荒卷大輔（塾一久 配音）拒絕將其交給陸軍情報(bào)部穗積上校（慶長佑香 配音），而是命令草薙將艾瑪護(hù)送至501機(jī)關(guān)接受調(diào)查。草薙在少女身上不僅發(fā)現(xiàn)兩個(gè)靈魂的存在，更觸摸到了被官方、軍方可以隱藏的悲慘真相……