好奇心旺盛且最喜歡不可思議事物的朝日奈未來，在成為初中二年級生的春假，與魔法使少女理子相遇。在奇跡與魔法的引導(dǎo)下，她與理子一起變身為傳說中的魔法使——「光之美少女」！未來牽起真愛的熊布偶毛芙倫與從「波紋智慧書」誕生的妖精小哈的手，攜手并肩擊退了威脅「魔法界」與「無魔法界（人類界）」兩個(gè)世界的混沌。然而，這也意味著與大家的分別。數(shù)年后，未來等人奇跡般地再次相遇，并開始在各自的世界走向?qū)儆谧约旱奈磥怼Ｎ磥碓跓o魔法界成為了一名大學(xué)生，而回到魔法界的理子則在魔法學(xué)校擔(dān)任老師。毛芙倫依舊陪伴在未來身旁，而小哈則成為了從遙遠(yuǎn)的地方守望世界的存在——然而，此時(shí)魔法界與無魔法界卻迎來了新的災(zāi)難……？以新災(zāi)難的預(yù)兆為契機(jī)，分別數(shù)月后再次相會(huì)的未來與理子，在擊退神秘?cái)橙说耐瑫r(shí)，兩人也將直面自己的過去與未來——用「CureUpRapapa！」的魔法咒語，再次開始令人興奮不已的故事。