《川西剿匪記》講述了新中國誕生的暮鼓晨鐘中，川西煙道要塞兩河口的青年周致斌與江湖戲班女子丹鳳一對苦命鴛鴦的愛恨情仇。
血性青年周致斌，與戲班臺柱子丹鳳在萬年臺上飛刀定情。卻不想父親周文軒也傾慕上了丹鳳的豪氣與俠義。國民政府派來的新任縣長的一紙禁煙令，將兩河口卷入了爭奪煙道的血雨腥風。周致斌與鎮(zhèn)長之子張濟邦、兩河孤兒黃登寶結為兄弟，誓死保衛(wèi)兩河口。三人為救丹鳳，幾次勇闖匪窩，卻被煙道大土匪金剛鉆活捉。陰差陽錯間，黃登寶投奔金剛鉆碼頭，成為了他手下的一名得力悍將。張濟邦遭惡人陷害，被開明的縣長馬玉之暗地里送到了省城的軍校去讀書。而周致斌則為救丹鳳，被金剛鉆打成瘸子。丹鳳為保周致斌不死，只得答應金剛鉆嫁給周文軒做填房。一場浩大的婚宴后，一對昔日的戀人，成了二娘和繼子……
周文軒在官匪勾結中被害喪命，使得周致斌和丹鳳遭到世人的誣蔑和唾棄。丹鳳謹記周文軒死前的遺愿，用“二娘”的身份撐起了整個周家。周致斌受不了昔日的周家在兩河口落到今天的田地，只得自己離開了兩河口，去省城投靠參加軍校的張濟邦。將父親死的罪責歸到自己身上的周致斌在金剛鉆的引誘下，沾染上了煙土。因無錢支付煙館的開銷，被人毒打一頓送回兩河口。得勢的小人李耀武借機將周致斌五花大綁上萬年臺，讓他當著全鎮(zhèn)人的面，成為了“一條狗”。丹鳳用周家的房契和全部家當換回了周致斌的一條命，自己卻抱著周家祖宗的牌位住進了破舊的茅草屋。周致斌好不容易來到省城的軍校，得到的卻是濟邦和縣長的女兒馬菊花因是共產黨已被槍斃的消息……姜維淑將落魄成乞丐的周致斌救回到丹鳳的茅草屋內，看著眼前的一切，周致斌終于醒悟了自己肩上對周家和二娘的責任。決心血債血償?shù)闹苤卤鬄榱私o父親報仇而大開殺戒。丹鳳不忍看周致斌被世道變成惡魔，用母愛的溫情幫助他戒掉大煙，又讓他娶下懷有濟邦骨肉的姜家小姐姜維淑，想讓他重回家的溫暖。黃登寶因金剛鉆殺死了自己的妻子徐二小姐而耿耿于懷。借周致斌與姜維淑大喜的婚宴，周致斌與黃登寶新仇舊賬一起算，聯(lián)手殺死了金剛鉆。維淑因自己被蒙在骨里，而對未來的生活充滿了擔憂。周致斌終于坐上了兩河口鎮(zhèn)鎮(zhèn)長的寶座，黃登寶也順理成章的成為了煙道上最大的匪首……
共產黨禁煙剿匪的消息傳入兩河口，黃登寶在幕后大鱷林四爺?shù)呐e薦下離開兩河口參加了黃埔軍校。周致斌發(fā)現(xiàn)了兒子周維的身世之謎，因為丹鳳和維淑隱瞞了自己而大發(fā)雷霆。丹鳳明白周維和自己是橫在周致斌與維淑之間的兩道鴻溝，她決定悄悄抱走周維，讓周致斌和維淑從此過上幸福的生活。在維淑的堅持下，丹鳳最終一個人離開了周家。周致斌感懷“二娘”的一片苦心，只得認下周維，和維淑過上了平淡寧靜的日子。張濟邦在谷毅團長和馬菊花的幫助下進步神速，當上了解放軍的連長。當“已死”的濟邦成為解放軍連長，而登寶成為國民黨反動派的特派員，兩人帶領各自的隊伍重回兩河口時，周致斌茫然失措。隱居山林多年的丹鳳得到兩河口不安定的消息，帶著義子水牛重回周府。愚昧的周致斌擔心張濟邦的“起死回生”會奪走維淑和周維，共產黨的“共產共妻”會讓自己重新變得一無所有。所以周致斌拒絕和共產黨合作，堅決不肯打開兩河口讓解放軍進駐。黃登寶在林四爺?shù)闹甘鞠吕弥苤卤髮垵畹膿鷳n從中挑撥離間，使周致斌與張濟邦漸行漸遠。張濟邦為了解開周致斌的心結，與暗戀自己多年已經產生革命情誼的馬菊花結婚。
在得知自己尋找多年的親人就是登寶的情況下，丹鳳明辨是非，認準了只有解放軍才能還世人一片晴天。在丹鳳與濟邦的支持和幫助下，周致斌最終完成了人性的轉變，站到了正義的一方。向著黑暗越走越遠無法自拔的黃登寶，不惜用丹鳳和維淑的生命來要挾周致斌與張濟邦。危難關頭，丹鳳拉響了身上的引線，炸開了解放軍通往兩河口的道路，用自己最寶貴的生命唱出了最后的挽歌。經歷了人生起伏、人性跌宕、愛恨情仇的周致斌，最終選擇和張濟邦、姜維淑、周維等一起迎來了新中國的勝利。
