上世紀(jì)50年代，由于國(guó)內(nèi)外形勢(shì)的發(fā)展變化，中國(guó)自主的核工業(yè)計(jì)劃正在如火如荼地進(jìn)行當(dāng)中。在這樣的背景下，一列來(lái)往于首都北京與西北核基地之間的神秘火車(chē)承擔(dān)起了運(yùn)送核專(zhuān)家前往核基地的一系列秘密任務(wù)。
北京市公安特勤所所長(zhǎng)龍飛進(jìn)入到護(hù)送核專(zhuān)家行動(dòng)組并擔(dān)當(dāng)了第一次運(yùn)送任務(wù)的負(fù)責(zé)人，漂亮的女乘務(wù)員辛紅羽對(duì)龍飛一見(jiàn)傾心，然而列車(chē)上的四位核專(zhuān)家對(duì)國(guó)家核武器研發(fā)的整體計(jì)劃極為關(guān)鍵，龍飛責(zé)任重大，不敢有絲毫懈怠。龍飛在列車(chē)上發(fā)現(xiàn)并抓捕了破壞運(yùn)送核專(zhuān)家任務(wù)的犯罪嫌疑人，在突審的當(dāng)口列車(chē)突遇前方鐵軌上的包裹，龍飛帶人急忙趕去，不料列車(chē)突然爆炸，四位核專(zhuān)家當(dāng)場(chǎng)殞命……
龍飛在案件審查過(guò)程中遇到核科學(xué)家楊佑亭的女助手謝寶音。
杜明明是別人要給龍飛介紹的女朋友，然而卻在龍飛出差期間與他的同事加好友肖克確定了戀愛(ài)關(guān)系。在列車(chē)鐵軌上發(fā)現(xiàn)的包裹被證實(shí)為遭到肢解的人體軀干，一系列的碎尸案件的頻發(fā)令火車(chē)爆炸案的偵破變得撲朔迷離……
碎尸案的真兇終于浮出水面，兇手尹大龍異常兇殘狡猾，在經(jīng)過(guò)精心策劃后，兇手設(shè)計(jì)劫持了秘密運(yùn)送的核專(zhuān)家楊佑亭。經(jīng)過(guò)一番偵破，龍飛、肖克等人發(fā)現(xiàn)了幕后指使——梅花組織的上級(jí)特務(wù)周明天，龍飛借機(jī)潛伏成特務(wù)，力圖打入梅花黨組織內(nèi)部。不料任性的杜明明也潛伏至周明天身邊，陷入與周明天、肖克的“三角戀愛(ài)”中……
辛紅宇龍飛劇照之后杜明明被掐死于體育館中。
被劫持的核專(zhuān)家楊佑亭被發(fā)現(xiàn)有假，原來(lái)有人冒充并試圖進(jìn)入核基地。周明天被最終證實(shí)不是爆炸案的實(shí)施者，這背后另有其人。
周明天被打下山崖，梅花黨組織的一些成員也被緝拿歸案，似乎已經(jīng)平靜的生活仍然隱藏了更大的罪惡與真相。謝寶音欲毒害龍飛且殺死了辛紅羽，還想殺死楊教授，最終自殺。龍飛從一系列的事件中，覺(jué)察出了敵人的蹤跡，原來(lái)真正的敵人——梅花黨組織的更大頭目就常年埋伏在公安組織的內(nèi)部……
可以說(shuō)，《秘密列車(chē)》繼承了張寶瑞小說(shuō)系列一貫的驚險(xiǎn)玄疑風(fēng)格，在環(huán)環(huán)緊扣的故事情節(jié)中，將敵我錯(cuò)綜、正邪難辨、明暗互現(xiàn)的斗爭(zhēng)展現(xiàn)出來(lái)，追求一種心理上的緊張和刺激。 而人物之間的關(guān)系也復(fù)雜難辨：情人？敵人？知己？對(duì)手？正是在他們針?shù)h相對(duì)的斗爭(zhēng)中，故事被逐步推向高潮……
王雅捷在劇中的身份更是成了劇中的一個(gè)亮點(diǎn)，她身份的曝露帶來(lái)了更為驚人的秘密。為人物、情節(jié)的發(fā)展起推波助瀾的作用。目前該劇已經(jīng)在山西榆次開(kāi)始拍攝完畢，并且還會(huì)在敦煌、嘉峪關(guān)等地取景拍攝。
