第一二集內(nèi)容：
　　King Sombra曾經(jīng)統(tǒng)治小馬國邊緣的水晶王國，帶來了無盡的苦難。后來他被塞拉斯迪亞公主和露娜公主聯(lián)合擊敗，變成陰影，并被放逐。一千年后，King Sombra卷土重來，想要重新統(tǒng)治水晶王國。大公主希望暮光閃閃(twilight sparkle)一行去保護水晶王國，免受King Sombra的再度襲擊。他們克服重重困難和阻撓，去保護水晶王國，并讓那里再度恢復(fù)生機。
　　第三季的制作團隊基本保留了第二季的結(jié)構(gòu)，勞倫浮士德依然退出。
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　　MLP:FiM是什么？小馬迷是什么？——參考第一季劇情簡介

　　本作確定分割兩季度放送

　　路德在天界是住在由罪犯的后代所居住的貧民窟里，他從小就被父母拋棄，后來被雷古特?fù)狃B(yǎng)長大。路德的雙手不知為何有嚴(yán)重的燒傷，于是雷古德給了他一雙手套遮住傷痕，而路德也非常珍惜這雙手套。路德非常愛惜舊物，常常去天界人垃圾堆撿還可以修補的舊東西。但是有一天，一個神秘人闖入路德家并殺死了雷古特，路德被誤認(rèn)為是兇手，所以被判丟下奈落之刑罰，路德本來以為自己會死，沒想到因此來到了下界……

　　爸爸是英雄，媽媽是精靈王，艾蓮擁有專屬于科學(xué)家的獨特技能——根據(jù)自己的喜好來改變物質(zhì)的結(jié)構(gòu)與合成。
　　在爸爸、媽媽與精靈們的寵愛下，艾蓮幸福成長，卻在和爸爸造訪人間之際被國王盯上，全家人陷入危機？
　　人類和精靈200百年前的糾葛重新被提起，兩族似乎永遠(yuǎn)無法重歸于好……
　　詛咒再一次降臨人界，無數(shù)無辜人民受害。精靈艾蓮決定，運用知識和力量，守護人類也守護家人。

　　2063年，地球進入游戲時代，少年葉昊覺醒王者賬號，為了親人逆風(fēng)翻盤，越級反殺異世妖獸，征服少女收獲芳心，最終成功阻止了滅世陰謀，守護家人。

　　長得像嬰兒一樣可愛的里包恩（西萩五十鈴 配音），真實身份其實是令人聞風(fēng)喪膽的意大利黑手黨殺手。他奉彭格列的第九代老大的命令，來到日本尋找彭格列的第十代老大沢田綱吉（國分優(yōu)香里 配音），并把他培養(yǎng)成合格的接班人。 沢田綱吉外號廢柴綱，就讀于并盛中學(xué)一年A班，全科成績平均17.5分，跳馬只能跳三層，單杠向上翻轉(zhuǎn)也不會，無論做什么事都不行的廢柴。里包恩行為搞怪過激，讓一向邋遢不求上進的綱頭疼不已。但是里包恩通過必死彈，竟然讓并盛中學(xué)的偶像笹川京子（稲村優(yōu)奈 配音）對一直默默無聞的綱產(chǎn)生了好感。綱慢慢開始接受里包恩的改造，過起了歡樂和恐怖的生活，并向黑手黨首領(lǐng)一步步邁進。

　　在第二次新吉恩戰(zhàn)爭、別名“夏亞的叛亂”終結(jié)后，地球圈取得了短暫的和平。
　　這之后3年，宇宙世紀(jì)0096年。在工業(yè)殖民地“工業(yè)7號”上進行了一項秘密交涉。內(nèi)容為－－被認(rèn)為是地球聯(lián)邦政府暗中操控的“比斯特財團”將把最高機密“拉普拉斯之箱”交給新吉恩的殘黨軍“袖付”。
　　另一方面，在安納海姆工業(yè)專門學(xué)校就讀的少年巴納吉·林克斯遇見了自稱為奧黛麗·本的少女（實為舊吉恩公國次男多茲魯·扎比之女，美耐巴·扎比）奧黛麗為了制止新的戰(zhàn)爭爆發(fā)，必須組織“拉普拉斯之箱”的交易。巴納吉在數(shù)次幫助奧黛麗之后，逐漸被她所吸引。
　　隨后，地球聯(lián)邦察覺了這起交易，并進行軍事介入，工業(yè)殖民地隨即化為一片火海。巴納吉和同伴一邊避難一邊尋找著奧黛麗，而出現(xiàn)在他面前的是比斯特財團的當(dāng)家卡迪阿斯·比斯特。奄奄一息的卡迪阿斯將出生的秘密告訴了巴納吉，并且將箱之鑰匙－－“機動戰(zhàn)士高達獨角獸”托付給他。
　　隨后，一場圍繞“拉普拉斯之箱”的戰(zhàn)爭開始了……

　　在第二次新吉翁戰(zhàn)爭、別名‘逆襲的夏亞’終結(jié)后，地球圈取得了短暫的和平。這之后3年，宇宙世紀(jì)0096年。在工業(yè)殖民地“工業(yè)7號”上進行了一項秘密交涉。和地球聯(lián)邦政府有秘密協(xié)議，并依此發(fā)展的‘畢斯特財團’打算將過去用以威脅聯(lián)邦的最高機密“拉普拉斯之盒”交給新吉翁的殘黨軍“袖章”。

　　秀知院學(xué)園是秀才云集的精英學(xué)校，在學(xué)生會中擔(dān)任學(xué)生會副會長四宮輝夜遇見了學(xué)生會長白銀御行。
　　原以為這兩個任誰都覺得很登對的天才應(yīng)該很快就會在一起，但這兩人卻因為過高的自尊心導(dǎo)致他們終沒能向?qū)Ψ礁姘住?br/>　　“該用什么辦法才能讓對方向自己告白呢？”在這場戀愛頭腦戰(zhàn)中用盡各種智慧謀略、身經(jīng)百戰(zhàn)的兩人，各自在心中下了某個決心。
　　在秀知院學(xué)園高中部的文化祭“奉心祭”的最終日到來前，兩人的戀情將會出現(xiàn)巨大的進展。

　　原島拓也、時村和樹和須賀沼大三名少年機緣巧合地獲得了神奇的寶石パワーストーン，并喚醒了勇者機器人ドラン。而ワルザック共和帝國的第一王子ワルター則為了自己的野心而對三人發(fā)動了攻擊，于是少年們的戰(zhàn)斗就這么開始了。

　　曾經(jīng)，小林三平（喜多村英梨 配音）和一位少女有著一個浪漫的約定，一晃眼十年過去，雖然兩人此刻早已天各一方，但小林從未忘記過這段美好的回憶，并且時刻希望能夠再度獲得這位少女的音信。
　　某個平平無奇的早晨，當(dāng)小林睜開眼睛時，卻發(fā)現(xiàn)一個紅衣綠發(fā)的機器人出現(xiàn)在自己的身邊，機器人名叫可美克（齋藤千和 配音），它此番前來尋找小林，竟然是為了和他結(jié)婚。就這樣，小林在莫名其妙之中開始了和可美克的同居生活，與此同時，陪伴在小林身邊的還有他的青梅竹馬牧原泉（高橋美佳子 配音）、電波少女早川美咲（釘宮理惠 配音）和搜查官黑崎涼子（白石涼子 配音）。