奧莉薇（長江里加 配音）是學校里新來的轉校生，金發(fā)碧眼的她生得一副標準的外國人面孔，但實際上，無論是出生和成長都在日本境內的她，根本就一丁點英語都不會說。野村香純（小原好美 配音）擁有著過人的智商，在幾乎全部的學科上都是頭籌的位置，但偏偏對英語這門科目不感冒，不只是不感冒，香純的英語成績只能用慘不忍睹來形容。奧莉薇的出現讓香純看到了希望，她打算拜托對方幫自己補習英語。
　　本田華子（木野日菜 配音）看上去有些呆呆的，常常會做出一些傻事，但成績卻意外的不錯，對現充生活充滿了憧憬的她，卻同奧莉薇和香純一起，被拉入了游戲的世界之中。

　　1998年夏季，擁有預測型未來視的女孩瀨尾靜音（井口裕香 配音）邂逅伽藍之堂的黑桐干也（鈴村健一 配音）。從對方口中，她了解到未來視的真相，心中的疑惑和焦慮也煙消云散，但同時也看到了干也悲劇性的未來。另一方面，擁有測定型未來視的職業(yè)炸彈狂魔倉密目琉夏，利用自己構建的未來制造一系列恐怖襲擊事件，直到他遭遇冷靜干練的兩儀式（坂本真綾 配音），命運的齒輪開始轉動。轉眼來到2010年，失去了未來視能力的瓶倉光瑠（石田彰 配音）轉行做了繪本畫家，命運安排他和兩儀式及其女兒未那（金元壽子 配音）相逢，此后他和崇拜自己的未那拜訪了傳奇占卜師觀布子之母……
　　本片根據奈須蘑菇以及武內崇創(chuàng)作的同名原作改編。

　　痛覺殘留：經歷了和職業(yè)炸彈狂魔倉密目琉夏的慘烈對決后，傷痕累累的兩儀式（坂本真綾 配音）待在家中靜養(yǎng)。適逢黑桐干也（鈴村健一 配音）需外出公干，他自顧自將一只黑貓托付給兩儀照看。兩儀與黑貓的關系巧巧起了變化；俯瞰風景：禮園女子學院八名女孩自殺，宮月理理棲（種田梨沙 配音）憑吊自殺的好友安藤由子，后悔自己沒有和她一同赴死。就在此時，業(yè)已失明的淺上藤乃（能登麻美子 配音）出現在宮月面前；新年參拜：1998年即將過去，干也和兩儀并肩走在去神社參拜的路上。寒冷的冬夜，兩顆孤獨之心不知不覺越來越近。
　　本片根據武內崇創(chuàng)作繪制的三個短篇漫畫改編。

　　“黑桐，你知道嗎，殺人和殺戮是不一樣的。據說，人一生只能殺一個人？”
　　從心底里渴望成為“特別”的存在。
　　這種愿望作出了錯誤的選擇。不，應該說是被錯誤引導出了這種愿望。那時候，深信這是唯一的也是最好的方法。
　　這是4年前也就是1995年和她相遇時發(fā)生的事。
　　次年即1996年，她陷入了沉眠。然而，罪惡的萌芽卻在不知不覺中發(fā)育成長。
　　然后，兩年后的1998年，她蘇醒了，開始鐫寫新的時刻。與此同時，想得到她的意圖也蠢蠢欲動……在，4年后的1999年。
　　所有得到她的手段都本該有破綻的。可是，命運的齒輪偏離了軌道。
　　4年之后再度反復的惡魔殺人事件。暗夜殺人犯是潛藏在她內心深處的殺人沖動和已經無跡可尋的“織”，已經想不起來。
　　到底殺的是“誰”，
　　為此，她徘徊在深夜的街頭，
　　為此，他為了她在黑夜里往復。
　　殺人和殺戮的不同，是特別和普通的差異，是戾氣和正氣的差別。明明重要的不是這些而是自己的存在，卻被這些對錯所囚禁——
　　明明希望的只是重要的人可以好好活著，這理所當然的事卻背負上了曾經的罪孽——

　　1999年2月，殺人鬼回來了！
　　1995年在日本發(fā)生的連續(xù)獵奇殺人事件，因嫌疑人遇到車禍住院而草草結案。如今瘋狂的犯罪再次出現，恐怖的氣氛來襲，原嫌疑人的嫌疑被洗清，到底誰才是這一系列事件的兇手？
　　解決都市不可思議事件的伽藍堂的成員開始展開調查，兩儀式準備以自己的匕首結束這一切。但決戰(zhàn)之前，黑桐干也發(fā)現犯人居然是自己舊日所識！
　　在友情與正義相混淆的世界中，干也到底要如何抉擇？
　　日本同人小說最高境界《空之境界》全七章動畫化，本作為第七章電影版。

　　1999年1月，黑桐鮮花所就讀的高級女子中學——禮園出現了神秘的事件。一年四班的學生橘佳織在宿舍起火事件中身亡，隨后，一年四班全體同學的生活改變了。每天活在痛苦與煩惱中的她們，收到了不明來源的信件。不安的情緒在禮園全體學生間蔓延。為了解決事件，兩儀式假扮學生潛入禮園，與黑桐鮮花一同調查事件的原委。另一方面，黑桐干也在使用自己的方法追蹤事件的真相。而事件的背后，似乎還有那個男人，魔術師荒耶宗蓮的安排。
　　蒼崎橙子之徒黑桐鮮花，擁有“直死之魔眼”的兩儀式，魔術與戰(zhàn)斗的交叉，禮園的秘密在她們面前展開。
　　日本同人小說最高境界《空之境界》全七章動畫化，本作為第六章電影版。

　　“荒耶，你在追求什么？”“真正的睿智?！薄霸谀睦镒非?？”“只在自己的心里?！?br/>　　1998年11月，胭條巴遇到了兩儀式并被她吸引。胭條巴每晚都做噩夢，自己犯下的罪行不斷重現。兩儀式為了調查事件的真相，前往胭條巴的寓所，卻不知道，他們不知不覺已經進了敵人的圈套——復雜的“矛盾螺旋”。
　　而在這一切的背后，是名為荒耶宗蓮的男子。他宿命的勁敵是魔術師蒼崎橙子，最強的人偶師。伽藍堂全體出動，賭上性命的戰(zhàn)斗即將開始。
　　日本同人小說最高境界《空之境界》全七章動畫化，本作為第五章電影版。

　　1998年06月，意外事故后昏睡兩年的兩儀式蘇醒了。
　　18年的記憶沒有了，兩儀織的人格也代替兩儀式死去了。只有名為“黑桐干也”的男子守護在自己的身邊。還有眼前奇怪的現象。兩儀式獲得了直視萬物死之線的異形之力“直死之眼”。
　　黑桐干也的上司，蒼崎橙子，來到醫(yī)院接觸兩儀式，教導她“直死之眼”的使用方法。醫(yī)院突然遭到襲擊，式手握匕首，跨出了2年來，最堅毅的一步。
　　日本同人小說最高境界《空之境界》全七章動畫化，本作為第四章電影版。

　　1998年7月，飲酒會歸來的下雨之夜，黑桐干也收留了一位無家可歸的少女。但不久，少女不辭而別，去向不明。
　　與此同時，發(fā)生了連續(xù)殺人事件。死者無一例外，都是由于身體被強大的力量過渡扭曲而死。伽藍堂開始為此展開調查。
　　一步步深入的調查，犯罪者居然是當時不辭而別的少女淺上藤乃，而她的能力更是驚人的強大。兩儀式，擁有“直死之眼”的少女，再次提起匕首迎戰(zhàn)。
　　日本同人小說最高境界《空之境界》全七章動畫化，本作為第三章電影版。

　　1995年9月，16歲的兩儀式與黑桐干也相遇了。
　　男孩子氣的兩儀式穿著和服來到學校，特殊的她與任何人都沒有交集，除了黑桐干也。二人產生了某種關聯，并開始了安穩(wěn)的校園生活。
　　同時，街上出現了連續(xù)獵奇殺人事件。由于警察朋友的關系，黑桐了解了一些內幕，他感到這個事件與式的雙重人格有某種關系。
　　兩儀式與兩儀織，獵奇殺人事件的真相到底是什么？兩儀家的秘密在黑桐眼前逐漸展開。
　　日本同人小說最高境界《空之境界》全七章動畫化，本作為第二章電影版。

　　1998年9月，圍繞巫條大廈發(fā)生了連續(xù)少女墜樓事件。媒體將其報道為無法解釋的自殺事件，而有一個人，看出了事件背后的某種關聯。
　　她是魔術師蒼崎橙子，伽藍堂事務所的所長。解決都市不可思議事件的伽藍堂只有三位成員：蒼崎橙子、黑桐干也、兩儀式。擁有“直死之眼”的兩儀式受橙子所托，前往巫條大廈調查。等待她的是意想不到的敵人，而對抗敵人的武器，只有那把一直在式手中的匕首。而遠在伽藍堂，黑桐似乎被巫條大廈的魔力控制，失去了知覺。
　　日本同人小說最高境界《空之境界》全七章動畫化，本作為第一章電影版。