侵華戰(zhàn)爭時期，日本人將掠得的北京猿人頭骨偷運回國，途中沉沒，成為一樁疑案。當年日本人將頭骨化石偷運回國，隱藏幾十年后，在和平環(huán)境下重新進行研究。他們將頭骨化石中的DNA殘片提取出來，進行培育，然后送入太空，據(jù)說這樣便可以憑借太空中的粒子幅射，使其蘊育成熟。不料，載著北京猿人胚胎的飛船失事，墜入海島，而北京猿人卻成功地誕生了。
而王祖賢扮演的中國美麗女間諜的使命就是將北京猿人偷運回國，從此便和日本科學家展開了明爭暗斗。最后，雙方不分輸贏，而是達成了共識：北京猿人不是任何一國的財富，他們屬于大自然。于是，猿人一家三口和一只同樣由基因技術(shù)復(fù)制出來的猛瑪象被放歸了自然。
