在精靈旅社125周年慶典派對上，一場意外使德古拉帶領(lǐng)的精靈家族首次變身成人，而約翰尼則成了怪獸。為了尋找治療方法，這對冤家翁婿前往危機重重的南美雨林開啟了一場歡樂又刺激的冒險之旅，遭遇了種種令人捧腹的窘?jīng)r。得知消息的梅菲斯帶領(lǐng)精靈家族前去營救愛人和老爸，他們最終能否將一切恢復(fù)正常？

小智和皮卡丘等一行伙伴在旅途中前行。某日，寶可夢波爾凱尼恩從天而降并被迫與小智鎖在了一起。波爾凱尼恩與被人類傷害過的寶可夢們共同生活，因此非常討厭人類，但這條神奇的鎖鏈卻讓他們無法分開，奇妙的故事就此開始。小智與皮卡丘又將一起開始新的冒險…… 另一方面，在超級機關(guān)城市阿佐特王國，大臣賈維斯得到了常年追求的終極發(fā)明——500 年前誕生于阿佐特王國的人造寶可夢瑪機雅娜。據(jù)說在瑪機雅娜體內(nèi)，有被稱為 “魂心”的未知力量，貪婪又邪惡的賈維斯企圖利用這股力量來統(tǒng)治王國。小智和波爾凱尼恩將會如何化解彼此的嫌隙？波爾凱尼恩與瑪機雅娜又有著怎樣的淵源？他們要如何共同對抗賈維斯拯救阿佐特王國？瑪機雅娜的最終命運又將如何結(jié)局？一場精靈寶可夢史上最偉大的戰(zhàn)役即將展開！

　　受到突如其來的怪獸襲擊，地球上的人類幾乎滅亡。為了人類最后的希望，由7名女性組成的TEAM·U守護著地球上最后的孩子。
　　與此同時，因為聽到呼喚而從其它宇宙前來的賽羅奧特曼、戴拿奧特曼和高斯奧特曼成功與TEAM·U會合。而侵略地球的幕后元兇百特星人，亦把魔手伸向地球上僅存的孩子……