《潘多拉的秘密》主要講述了以1931年“九一八”事變之后，日本侵略者控制東三省并加以侵略華北大地為背景，闡述了以“潘多拉”為代號的引誘下，幾位身份不同的情報(bào)人員在歷經(jīng)國仇、愛恨、紛爭后共同奮戰(zhàn)的傳奇故事。
1934 年底，三名執(zhí)行任務(wù)失敗，遭日軍俘虜?shù)膰顸h東北空軍將士，姜城、彭越和上官羽破，被國民黨方面組織人員解救回到天津，國民黨方面分析三人中一名已經(jīng)叛變。國民黨方面決定派琉璃子調(diào)查少校上官羽破，琉璃子遂對他進(jìn)行了監(jiān)控，上官都逐一應(yīng)對，且在空軍建設(shè)過程中，上官羽破始終表現(xiàn)突出。琉璃子在調(diào)查上官羽破的過程中，逐漸產(chǎn)生了對他的愛情，上官羽破對琉璃子也有好感，但上官羽破與女朋友墨純相處多年，這段感情使上官羽破與琉璃子都陷入糾結(jié)中。上官羽破逐漸地接觸了中共的一些主張，內(nèi)心形成了對共產(chǎn)主義的信念。國民黨方面漸漸把嚴(yán)查目標(biāo)轉(zhuǎn)向姜城、彭越，叛徒姜城終于伏法。1936年底，“西安事變”爆發(fā)，這使國民黨方面?zhèn)涫軌毫Γ瞎儆鹌婆c琉璃子接受了中共的抗日救國主張，踏上了尋找中國共產(chǎn)黨的道路。
