1897年，大韓帝國時代動蕩混沌，時有不同罪案發(fā)生，別巡檢調查隊四出調查，找尋破案的線索。
　　別巡檢第2季的時代背景為1897年大韓帝國的國號宣布之后，比第1季還要遲些。高宗自俄羅斯回國后自稱為皇帝，由此朝鮮便變?yōu)榈蹏?，以闡明國家的自主性和獨立性。并且施行了財政、教育、軍事等幾乎全方位的光武改革，令朝鮮向現(xiàn)代化邁進了一大步。因此這個時期應該是比第1季更為激動人心的時期，然而大韓帝國所追求的新價值，讓國民看到的卻是比任何時候都強大的同一與自主的混亂。

　　曾經(jīng)的棒球名校二子玉川高中因為一起惡性斗毆事件被取消了參賽資格。喪失比賽資格的同時，也讓棒球隊的一眾成員安仁屋（市原隼人 飾）、御子柴（小出惠介 飾）、新莊（城田優(yōu) 飾）、若菜（高岡蒼甫 飾）等丟失了自己的棒球夢，成為了讓學校頭疼的問題學生。
　　熱血青年川藤老師（佐藤隆太 飾）應聘到了二子玉川，正好教的是安仁屋所在的垃圾班。因一次偶然的機會看到哭泣的御子柴，了解了這群不良少年背后的故事。聽到御子柴哭著說想再次打棒球的川藤，決定要組建棒球隊，這引起了以安仁屋為首的一群人的抵觸。但天性樂觀的川藤面對這群表明兇神惡煞的不良少年，引出了不少令人雞皮疙瘩直起的熱血故事，而他們的目標直指甲子園。

　　高恩星（韓孝珠 飾）的人生本來也算一帆風順，唯一糾結的事就是自己偷偷改了專業(yè)，選擇就讀廚藝學校，正想找機會向自己的父親道清真相時，父親卻打來了越洋電話。告訴自己的弟弟高恩宇患上了自閉癥，讓她速速返回?；丶抑蟮亩餍?，遇到的是晴天霹靂般的巨變。弟弟變自閉了；父親破產了；繼母搶奪遺產了。而自己的行李也和路人拿反了。這個路人就是大財團的孫子鮮于煥（李勝基 飾），平日里頗為自傲，讓他的奶奶很是看不慣。某一天煥的奶奶出門失憶被恩星幫助，讓奶奶對恩星頗有好感，甚至把無家可歸的恩星接到了家里來住。讓煥一家最吃驚的事莫過于，奶奶居然把自己龐大的遺產都給了恩星！
　　這筆“燦爛”的遺產讓恩星飽受煥一家人的嫉妒和懷疑。而煥也由最初的敵視變成對恩星心生好感，故事在撲朔迷離中展開。

　　調皮伶俐的少女與一（宮崎あおい 飾）生于人杰輩出的薩摩。適逢歷史變革的動蕩時代，經(jīng)過長達兩百多年的鎖國，日本國內各方面早已出現(xiàn)僵化腐敗的局面；而海外列強紛紛崛起，開始將觸角伸向這個古老而神秘的國度。由于和外界多有接觸，以薩摩為代表的一部分有識之士渴望幫助日本成為現(xiàn)代化的強國，為此他們不惜采用各種手段改變國家的現(xiàn)狀。
　　島津齊彬（高橋英樹 飾）欣賞與一的聰慧與見地，于是將其收為養(yǎng)女，希望培養(yǎng)出一個能從幕府內部改革政府、引導國家走向的女子。肩負著歷史使命，更名為篤子的與一開始了將軍夫人的艱苦磨練。從此，她的人生將與齊彬、家定（堺雅人 飾）、大久保利通、西鄉(xiāng)隆盛（小澤征悅 飾）、慶福（松田翔太 飾）、勝海舟（北大陸欣也 飾）、小松帶刀（瑛太 飾）、慶喜（平岳大 飾）等一系列在幕末明治時代占有重要歷史地位的人物緊緊糾纏在一起……

　　大三學生小山一美（小栗旬 飾）是個超級大好人，他的優(yōu)點同樣也是他的缺點，就是他從不說NO。小山不忍心看到別人被拒絕后失望的眼神，于是他參加了眾多社團，幫助了眾多的人，擁有大批知心或不知心的朋友。這樣的生活讓小山雖然精神極度愉悅，可物質上卻因為幫人借債而極度貧乏。
　　找到工作的小山開始了在還債借債還債的循環(huán)中生活，而他也因此邂逅了許多和他一樣面臨著債務危機的人。其中有為了舒緩壓力的購物狂中原未海（山田優(yōu) 飾），有被婚姻欺詐師騙過的不能結婚的男人引田修三（八島智人 飾），幫失蹤的父母還債的白石涼（三浦春馬 飾）等，在和他們的相處過程中，發(fā)生了許多極具現(xiàn)實意味的事情，有笑有淚。人生還有許多比金錢更重要的事，物質可以貧乏，精神卻決不能貧乏。

　　奮斗多年，終于考上10級公務員的辛未來（金宣兒 飾）在偏僻的小地方做起了端茶倒水的活。雖然離她的夢想，即考上9級公務員還有一定的差距，但是未來還是每天快樂的過著日子。因為一次選美小姐比賽，未來邂逅了祖國（車勝元 飾）。祖國是個行政考試的天才，而他的志向更是非常宏大，目標是成為總統(tǒng)。與未來的初次相遇，讓他很是看不慣這個邋遢的小公務員。但各種陰差陽錯和弄巧成拙后，未來竟然成為了市長。
　　不得不硬著頭皮干下去的未來得到了祖國的協(xié)助，在這位專業(yè)知識儲備強人的協(xié)助下，起初手足無措不知如何是好的未來也開始慢慢步入正軌，干得有模有樣。而二人也在一來二往中，漸漸萌生出情意。市政廳的愛情故事就此上演。

　　夏天、海邊、煙火盛宴。一群高三生好朋友們在夜晚的海邊慶祝自己的變化。升到高三的他們自此有了新的稱呼，那就是“考生”。這群考生包括根岸洋貴（岡田將生 飾）、白崎凜久（北乃綺 飾）、田幡八朗（濱田岳 飾）、屋嶋燈里（吉高由里子 飾）等人。他們除了學業(yè)上的事，生活中也經(jīng)歷著青春期必經(jīng)的煩惱。在第二天上學的途中，洋貴經(jīng)過海邊，聽到了小孩的呼救聲，待他趕去營救時，發(fā)現(xiàn)小孩已被一個男人救起。更不思議的是，這個男人就是學校新來的老師櫻井朔太郎（織田裕二 飾）。
　　于是不像老師的櫻井和這群性格各異古靈精怪的學生開始了這最后一年的高中生活。一段段感動又勵志的故事就此上演。