劇集以中華傳統(tǒng)美食為主線，講述了民間出身的年輕廚娘凌小小立志成為“天下第一御廚”，通過(guò)層層考驗(yàn)來(lái)到皇宮，憑借出眾的廚藝成功得到太子賞識(shí)，并與太子相知相愛的曲折故事。機(jī)智善良的凌小小了毫不畏懼皇帝、皇后、貴妃、晉王等人的為難和考驗(yàn)，在太子的幫助下，一次次以高超的廚藝、美味的菜肴化解危機(jī)。她逐步成長(zhǎng)，最終收獲了愛情，友情和事業(yè)。

故事從一個(gè)夕陽(yáng)如血的黃昏開始，幼年時(shí)的歐陽(yáng)正（陳曉東飾）流落到北方小鎮(zhèn)。歐陽(yáng)正父母都是警察，但都已去世。他與當(dāng)時(shí)父母被造反派打倒的聞汐（鄧超飾），以及寄養(yǎng)在外婆家的葉雨（高圓圓飾）青梅竹馬一起長(zhǎng)大。文革結(jié)束后，聞汐和葉雨都隨父母返回了省城，臨別之時(shí)葉雨留給了歐陽(yáng)正純真的誓言“長(zhǎng)大了我來(lái)找你，別忘了”。成年后的三人境遇迥異，歐陽(yáng)正終于考上了大學(xué)，進(jìn)入省城后先后重逢了已是愛生活，愛5Q的聞汐和葉雨。艱難生存的歐陽(yáng)正在得知聞汐鐘情于葉雨時(shí)，拒絕了葉雨的感情。畢業(yè)后，歐陽(yáng)正被分配到邊遠(yuǎn)的小鎮(zhèn)，幾年后他重回省城，落魄謀生。在遭遇殘酷的人生變遷之后，歐陽(yáng)正和葉雨重逢在海邊…… 　　一個(gè)夕陽(yáng)如血的黃昏，童年的歐陽(yáng)流落到一個(gè)臨海的北方小鎮(zhèn)上，他的父母都是警察，但他們都已經(jīng)死去。 　　歐陽(yáng)便和鎮(zhèn)上他那單身的叔叔相依為命，叔叔是個(gè)很激烈的人，唯一的嗜好就是喝酒，叔叔也有喜歡的女...

　午夜12點(diǎn)，在繁華都市的一個(gè)小角落，一家食堂才剛剛開始營(yíng)業(yè)。這家深夜食堂的老板(小林薰 飾)雖然臉上帶著傷疤，卻是一個(gè)溫情且廚藝精湛的男人。雖然小店里的菜譜很簡(jiǎn)單，但是只要是客人想吃的都可以點(diǎn)，所以小店備受底層小市民的喜愛。延續(xù)第一季的風(fēng)格，深夜食堂里每晚都上演一個(gè)耐人尋味的故事，每個(gè)故事的主角都有自己鐘愛的一款美食。特別值得一提，第一季曾出現(xiàn)的紅色香腸再度登場(chǎng)，其中埋藏多年的往事隨之揭曉，曾經(jīng)的故人再度聚首，又展開了一個(gè)嶄新的溫情故事……
　　《深夜食堂》在2006年開始連載，由于作品氣氛濃郁、風(fēng)格特殊，二度改編日劇播映，由小林薰擔(dān)任男主角。隔年獲得“第55回小學(xué)館漫畫賞”及“第39回漫畫家協(xié)會(huì)大賞”。

　　大東集團(tuán)財(cái)務(wù)部部長(zhǎng)藤浩在即將舉行婚禮之前，卻被警方拘審。原因是集團(tuán)595萬(wàn)元的巨款被人利用轉(zhuǎn)賬支票提走，而掌管財(cái)務(wù)印章的藤浩涉嫌監(jiān)守自盜。警察賈超西將矛頭對(duì)準(zhǔn)了青年企業(yè)家史哲明和藤浩的摯友莊海，但在展開調(diào)查時(shí)，史哲明被燒死在汽車內(nèi)，莊海則涉嫌殺人并帶著涉嫌詐騙的巨款消失無(wú)蹤。五年后，當(dāng)藤浩和史哲明的女朋友舒小凡相愛之時(shí)，一個(gè)名叫齊明宣的海外歸來(lái)的文化人闖入了舒小凡的生活。他毫不掩飾地追求舒小凡，言行舉止讓舒小凡感覺似曾相識(shí)。就在藤浩發(fā)現(xiàn)了一些蛛絲馬跡之時(shí)，他卻陷入了齊明宣精心設(shè)計(jì)的陷阱，最終因被指控殺人罪被判處死刑。
　　齊明宣的事業(yè)蒸蒸日上，盡管人們懷疑他就是當(dāng)年被害的史哲明，但卻找不到直接的證據(jù)。警察賈超西在境外尋找線索，但進(jìn)展甚微。另一方面，沈晗被藤浩的精神所感動(dòng)，決定應(yīng)聘到齊明宣的公司當(dāng)臥底。然而，當(dāng)他錄下了一盤證據(jù)錄像帶之后，卻被齊明宣推下高樓身亡。舒小凡深愛著藤浩，但假借不能忍受藤浩和羅薇的舊情復(fù)燃之名，投入了齊明宣的懷抱。她通過(guò)身體的感覺確認(rèn)了齊明宣就是史哲明。最終，齊明宣承認(rèn)了自己當(dāng)年將莊海殺害，并偽裝成自己燒焦的尸體。他整容成為了兒時(shí)伙伴齊明宣的模樣，并將齊明宣殺掉，企圖掩蓋自己的罪行。

胡珊寶（郭采潔 飾）的家里世代以燒制叉燒為業(yè)，她的身上因此而沾上了抹不去的叉燒味，再加上發(fā)達(dá)的肌肉和簡(jiǎn)單的頭腦，常常遭受嫌棄。胡珊寶有一個(gè)最大的愿望，就是覓得真命天子，成為家庭主婦，然而，特殊的身份卻總令她同真愛擦肩而過(guò)。