即將升上初中二年級(jí)的朝日奈未來(lái)，在春假的某天晚上，看到一神秘物體從天落入附近的公園里。“難道是魔法使？”，興奮的未來(lái)第二天一早就和自小就喜愛(ài)著的絨毛玩具熊“毛芙倫”一起向公園前進(jìn)。結(jié)果在那里看到的是……騎著掃帚漂浮在空中的女孩……自稱是理子的那個(gè)女孩子，竟然是魔法使。
未來(lái)對(duì)魔法使非常感興趣，對(duì)理子問(wèn)東問(wèn)西的。理子好像是為尋找“某物”而來(lái)到未來(lái)居住的世界。此外，仔細(xì)一看，她們兩人帶著同樣的吊墜…。
就在此時(shí)，暗之魔法使?多庫(kù)羅克希的部下巴提在兩人面前出現(xiàn)。他逼迫理子交出“波紋翡翠”（リンクルストーン?エメラルド，Wrinkle Stone Emerald），但是理子好像也在尋找“波紋翡翠”……
當(dāng)被巴提的黑暗魔法所誕生的怪物欲望怪逼入絕境時(shí)……未來(lái)和理子、還有毛芙倫手牽著手，不斷地喊出魔法的咒文“Cure Up?Rapapa! ”，吊墜突然發(fā)出了光輝。
于是，傳說(shuō)的魔法使“光之美少女”就此誕生。
