阿力和貝貝都是優(yōu)秀的科研小潛艇，他們是一對非常好的拍檔，在《潛艇總動員》中，他們共同完成了很多次的訓(xùn)練和任務(wù)，這一次，兩個小家伙將面臨什么樣的神秘而有趣的挑戰(zhàn)呢？
著名的海洋研究學(xué)家及水下考古考古學(xué)家蘇紅博士擁有四枚加勒比海盜藏在深海中的上古勛章的仿制品，四枚勛章分別代表了智慧、勇氣、友誼和正義。這一天，蘇紅博士召集阿力和貝貝，交代他們?nèi)绻軌蛲瓿梢豁椚蝿?wù)將會獲贈一枚勛章，如果能夠收集齊四枚勛章，小家伙們將獲邀去泉州參加海洋博物館的開幕儀式，并將獲得博士贈送的神秘獎勵，這讓小潛艇們激動不已，躍躍欲試！
阿力和貝貝和海上摩托艇蛙蛙、寵物猴淘淘、海上單腳滑行艇石頭等小伙伴一起，團結(jié)合作、不畏困難，相繼出色完成了地中海埃及女王皇冠搜尋、北冰洋佩斯號殘骸搜尋、阿拉伯海古城石板搜尋、整合沉船文物保護的任務(wù)，陸續(xù)獲得博士頒發(fā)的四枚勛章并回到泉州，經(jīng)歷驚險的搜尋后找到鄭和沉船的船錨，把這珍貴的文物當做禮物送給即將開幕的泉州海洋博物館。
小潛艇們不負眾望完成了蘇紅博士交給他們的所有任務(wù)，蘇紅博士兌現(xiàn)自己的諾言，她安排在泉州海洋博物館開幕式上，燃放了小潛艇形象的煙花作為驚喜獎勵。
通過海洋探險的經(jīng)歷，小潛艇們不僅變得更加成熟、勇敢、團結(jié)、合作，還了解到悠久的海洋文明、學(xué)會了海洋文物保護等很多有用的知識，從而成為真正的潛艇小英雄！
