香港SARS疫潮過后，人們終于從陰霾中走出來。腦外科醫(yī)生程至美（吳啟華飾）突然得知前女友的死訊，情緒崩潰，極度自責抑郁。法醫(yī)岑雅晴（黎姿飾）伴其左右，鼓勵他重新建立信心。急癥室醫(yī)生黎國柱（林保怡飾）結束了與女友的戀情，卻卷入與骨科醫(yī)生葉淘（吳美珩飾）及見習醫(yī)生曾淑淇（廖碧兒飾）的三角戀中。不幸感染SARS的心臟科醫(yī)生林敏智（陳豪飾）留下后遺癥，為保全名聲而隱瞞病情，卻令病情日益惡化。婦產科醫(yī)生萬安生（邵美琪飾）與急癥科醫(yī)生向眾仁（曹永廉飾）正計劃共同生活，然而卻因護士戴玉瑩（姚嘉妮飾）的介入而面臨一場情感考驗。
由香港無線電視制作的現代時裝醫(yī)務紀實電視劇《妙手仁心3》是《妙手仁心》系列的第三輯，監(jiān)制戚其義與編劇周旭明的黃金組合更是精心打造此輯“妙手系列”。此輯劇集在風格上延續(xù)了前兩輯經典之處，一如既往的得到醫(yī)務人員協助實景拍攝，繼續(xù)講述醫(yī)護人員在工作中的點滴故事。
