本片是以神木高中“古典部”為舞臺，圍繞四個(gè)部員折木奉太郎、千反田愛瑠、福部里志、伊原摩耶花展開的校園推理劇。神木高中一年級生折木奉太郎是一個(gè)“節(jié)能”主義者，他信奉“不必要的事不做，非做不可的事就盡快解決”，過著“灰色”的高中生活。不參加任何社團(tuán)的他，卻因?yàn)榻憬愕陌萃卸尤肓藶l臨廢部的“古典部”。在古典部他結(jié)識了好奇心旺盛的千金小姐千反田愛瑠，國中好友福部里志、伊原摩耶花也相繼加入古典部。
　　原來千反田失蹤已久的舅舅就是當(dāng)年古典部的部長，于是四人開始著手調(diào)查四十五年前古典部的神秘事件，而最大的線索就是當(dāng)年的社刊“冰果”。冰果里隱藏了什么樣的秘密，當(dāng)年的部長為什么要退學(xué)……
　　本動(dòng)畫改編自日本推理作家米澤穗信的古典部系列小說。

　　現(xiàn)在，再一次去往廣大的藍(lán)天——。
　　憧憬天空、以星之島為目標(biāo)的少年，與從天而降、不可思議的藍(lán)發(fā)少女，兩人成為了命運(yùn)與生命的共同體。向天空出發(fā)的少年與少女，與值得信賴的同伴和前往目的地的騎空艇相逢。經(jīng)由躲避帝國的追擊，以及與星晶獸的邂逅，兩人加深了牽絆并逐漸成長。但前往星之島的路程還只過了一半。少年與少女和同伴一起，向著接下來的旅程進(jìn)發(fā)。

　　這里是空中漂浮著眾多島嶼的空之世界。在信奉神秘的島嶼“賽克汀瑟”上生活的少年格蘭，以及會說話的羽蜥碧，某天，遇見了謎之美少女——露莉亞。露莉亞，是從企圖以強(qiáng)大的軍事力量支配這個(gè)空之世界的軍事國家艾爾斯提帝國那里逃來的。格蘭與露莉亞為了逃離帝國，帶著格蘭的父親留下的寫有“在星之島伊斯塔魯西亞等著”的書信，展開了前往壯大天空的旅程。格蘭，在賽克汀瑟島和羽蜥碧一起生活的少年。以失蹤了的父親留下的書信寫著的“星之島，伊斯塔魯西亞”為目標(biāo)，平時(shí)總是日不間斷地鍛煉，愛向有困難的人伸出溫暖的援手。以跟露莉亞的相遇為契機(jī)，離開故鄉(xiāng)踏上旅途。露莉亞，擁有駕馭星晶獸的能力的少女。被試圖研究這種特殊能力的艾爾斯提帝國幽禁起來。從帝國逃脫過程中被格蘭所搭救，和他一起踏上旅途。碧，從格林小時(shí)候開始就伴隨其左右一起生活，如同搭檔般的存在。喜歡吃蘋果。討厭被別人當(dāng)作蜥蜴和小動(dòng)物對待?？ㄋ蚰取喞驖桑瑺査固岬蹏尿T士。曾經(jīng)擔(dān)任露莉亞的護(hù)衛(wèi)和監(jiān)視工作，但是知道了帝國是想利用露莉亞來獲取強(qiáng)大的力量一事后，向帝國舉起了反旗。把露莉亞當(dāng)作妹妹一樣重視。拉卡姆，操縱飛渡天空的飛艇“騎空艇”的精明能干的操舵士。受到過去的事故的打擊而拒絕再乘上騎空艇。雖然看似很粗魯?shù)囊粋€(gè)人，實(shí)際上是很會照料別人，也有好管閑事的一面。

　　正在爆肝加班當(dāng)中的程式設(shè)計(jì)師，游戲中名為“佐藤”的鈴木一郎（29歲）。
　　原本應(yīng)該在小睡片刻的他，回過神竟發(fā)現(xiàn)自己被放逐到了陌生的異世界。
　　連慌亂的閑暇都沒有，一大群從未見過的怪物逼近眼前，流星雨自天空傾盆而降——
　　然后轉(zhuǎn)眼間，最強(qiáng)等級的力量和巨額財(cái)富都得手了。
　　就這樣，佐藤“溫馨，時(shí)而嚴(yán)肅，并兼具后宮”的異世界冒險(xiǎn)故事就此展開。

經(jīng)過南國小島上和鷹岡的決斗，3年E班的各位與殺老師（福山潤 配音）的關(guān)系進(jìn)一步拉近。雖然暗殺活動(dòng)仍在繼續(xù)，然而這似乎已經(jīng)變成了師生之間互動(dòng)玩樂的重要環(huán)節(jié)。以茅野楓（洲崎綾 配音）為代表的學(xué)生們又開始策劃更加精彩的暗殺陷阱。除此之外，他們幫助比琪老師（伊藤靜 配音）追求烏間惟臣（杉田智和 配音），又或者磨刀霍霍與A班的精英們展開榮譽(yù)與尊嚴(yán)之戰(zhàn)。與此同時(shí)，白先生帶領(lǐng)堀部系成（緒方惠美 配音）卷土重來，而神秘的死神則將E班推向各位兇險(xiǎn)的境地。隨著最后期限一天天逼近，殺老師和學(xué)生們的關(guān)系變得愈加微妙……                                    
                               　　本片根據(jù)松井優(yōu)征的超人氣漫畫改編。

故事發(fā)生在椚丘中學(xué)三年E班，表面上，這是一個(gè)普通的班級，然而實(shí)際上，這里聚集著的均是技藝高超冷酷無情的殺手。每一年，他們通過特殊渠道接收著來自世界各地的暗殺任務(wù)，替各國首腦“排憂解難”，而這一次，他們有了一個(gè)統(tǒng)一的目標(biāo)——刺殺班主任殺老師（福山潤 配音）。                                    
                               　　殺老師是一個(gè)神奇的存在，它的外表并非人類，卻有著及其敏感的神經(jīng)和及其迅速的反應(yīng)力，沒有人知道它從哪里來，也沒有人知道，它為何會變成三年E班的班主任。因?yàn)橄胍獨(dú)绲厍?，殺老師成為了暗殺名單上的高價(jià)懸賞人物，而作為三年E班的學(xué)生，只要成功消滅殺老師，即可畢業(yè)。就這樣，圍繞著這位神秘的老師，充滿了危險(xiǎn)的日常就此展開。