在距離東京南部一千公里的小宅島上，一家豪華酒店將迎來開業(yè)一周年的慶典，屆時會場將展出名貴的鉆石阿緹密斯之淚。理所當然，這顆鉆石吸引了怪盜基德的注意，他再次發(fā)出盜竊預告。雖然中森警部作了周密部署，卻依然防不勝防，阿緹密斯之淚最終失竊。與此同時，柯南、小蘭等人也受鈴木園子之邀參加了酒店的周年慶典。中森警部的出現(xiàn)引起柯南警覺，他繼而發(fā)現(xiàn)基德的計劃。
　　狡猾的基德接連逃脫中森警部和柯南的圍阻，不過卻在少年偵探三人組元太、步美、光彥的面前大失身手，還暴露了真容，不過卻被步美他們認作新一。另一方面，丟失了鉆石的酒店方似乎另有企圖……

這個星球被DS（達摩克里斯）科技軍隊占領，強AI（人工智能系統(tǒng)）是這個軍隊的首領。反抗AI和DS的鷹隼部隊，對瘋狗鎮(zhèn)（DS試驗場）進行肅清。原為瘋狗鎮(zhèn)電工卻擁有既視感（短暫預測未來）的馬三、神秘女子洛凝和改造人翎以及黑客小海一同反抗并逃亡。瘋狗鎮(zhèn)的主人（“神父”莫比）乘火箭逃離殖民星球，瘋狗鎮(zhèn)的眾人即將被火箭烈焰活活燒死，馬三為救眾人連接了AI天眼衛(wèi)星，成功阻止神父并和眾人逃出了瘋狗鎮(zhèn)，這一舉動暗示馬三可能來自DS，馬三也開始對既視感的來源產生懷疑？ 眾人來到被一群末世難民占領的廢棄驛站，這里的首領封子昂認出馬三，稱呼他為長官，隨即自愿幫助馬三找回記憶，但殊不知，這只是一場陰謀的前奏……